近年来，随着城市化进程的加快，越来越多的农村居民选择将废弃的农房改造成生活场所，这也带来了一些问题。有些人在改造的过程中，为了扩大住宅面积，去掉了院子的一部分，导致院子形状被破坏，这就引发了赔偿问题。
首先，需要明确的是，农村院子的形状破坏属于土地利用权的侵犯。按照我国《土地管理法》的规定，土地使用权归属于土地所有者，非土地所有者未经土地所有者同意，不能擅自占用土地。因此，如果有人在改造农房时，非法地将院子的一部分占为己有，就构成了对土地所有者的侵害。
针对这种情况，当事人要么可以自行协商解决，要么需要通过法律手段来维护自己的合法权益。如果当事人之间能够自行协商达成一致，可以签订一份合法有效的协议，明确双方的权利和义务，协商好赔偿金额并及时给予。
如果协商不成，当事人可以向当地农村土地管理部门提交申请，要求恢复土地使用权。如果被侵犯的土地是未被登记的，当地可以委托相关部门进行测绘，完善土地登记备案程序，进而确立自身权利。如果无法通过协商和申请解决纠纷，当事人还可以向法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的权益。
在赔偿问题上，一般可以从以下几个方面考虑：
1、恢复原状
如果能够恢复原状，是解决问题的最好方案。如可以将原本占用的院子土地还给土地所有者，并重新规划院子面积。
2、经济赔偿
如果无法恢复原状，就需要进行经济赔偿。一般赔偿的数额为被占用土地的市场价格，要考虑土地利用价值、土地市场价格和被占用时长等因素。
3、合理协商
双方在协商时应该遵循平等自愿、公开透明的原则，根据具体情况和特点，做到公平合理、公正透明。同时要充分考虑双方意愿、行动和能力等因素。
总之，农村院子问题并不是小问题，对农村土地利用权的侵害应该引起法律意识的高度重视。当人们在使用土地时，不仅要注重法律法规的规定，更应该充分尊重土地所有者的权益，保护和维护自己的法律地位。只有这样，我们才能够建设具有公平、和谐、文明的社会。
